Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms