Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cabp4Q8VHC5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms