Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cul7Q8VE73 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cul7Q8VE73 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cul7Q8VE73 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cul7Q8VE73 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cul7Q8VE73 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cul7Q8VE73 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cul7Q8VE73 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cul7Q8VE73 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cul7Q8VE73 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cul7Q8VE73 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cul7Q8VE73 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cul7Q8VE73 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cul7Q8VE73 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul7Q8VE73 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul7Q8VE73 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul7Q8VE73 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul7Q8VE73 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul7Q8VE73 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul7Q8VE73 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul7Q8VE73 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul7Q8VE73 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul7Q8VE73 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul7Q8VE73 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul7Q8VE73 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul7Q8VE73 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul7Q8VE73 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul7Q8VE73 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul7Q8VE73 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul7Q8VE73 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul7Q8VE73 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul7Q8VE73 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul7Q8VE73 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul7Q8VE73 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul7Q8VE73 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul7Q8VE73 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul7Q8VE73 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms