Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Smg8Q8VE18 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Smg8Q8VE18 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Smg8Q8VE18 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms