Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1aQ8VDS4 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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