Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d2Q8VD57 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d2Q8VD57 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d2Q8VD57 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d2Q8VD57 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d2Q8VD57 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d2Q8VD57 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d2Q8VD57 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d2Q8VD57 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d2Q8VD57 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d2Q8VD57 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d2Q8VD57 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d2Q8VD57 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d2Q8VD57 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d2Q8VD57 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d2Q8VD57 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d2Q8VD57 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d2Q8VD57 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sft2d2Q8VD57 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
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