Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn4Q8VCH8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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