Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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RfxapQ8VCG9 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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RfxapQ8VCG9 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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RfxapQ8VCG9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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RfxapQ8VCG9 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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RfxapQ8VCG9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms