Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnajc28Q8VCE1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms