Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BbxQ8VBW5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms