Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms