Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Impg1Q8R1W8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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