Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms