Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Colec12Q8K4Q8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Colec12Q8K4Q8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Colec12Q8K4Q8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Colec12Q8K4Q8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Colec12Q8K4Q8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Colec12Q8K4Q8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Colec12Q8K4Q8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Colec12Q8K4Q8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Colec12Q8K4Q8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms