Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28aQ8K3Y3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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