Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casc3Q8K3W3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms