Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OptnQ8K3K8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms