Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ssh3Q8K330 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms