Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms