Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms