Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gtf3c1Q8K284 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gtf3c1Q8K284 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gtf3c1Q8K284 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gtf3c1Q8K284 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gtf3c1Q8K284 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gtf3c1Q8K284 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gtf3c1Q8K284 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gtf3c1Q8K284 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gtf3c1Q8K284 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c1Q8K284 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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