Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms