Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms