Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJF9

Ago3, Protein argonaute-3, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ago3Q8CJF9 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ago3Q8CJF9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ago3Q8CJF9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ago3Q8CJF9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ago3Q8CJF9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ago3Q8CJF9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ago3Q8CJF9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ago3Q8CJF9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ago3Q8CJF9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms