Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms