Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Csnka2ipQ8CH19 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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