Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Hpf1Q8CFE2 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Hpf1Q8CFE2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Hpf1Q8CFE2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Hpf1Q8CFE2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Hpf1Q8CFE2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Hpf1Q8CFE2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Hpf1Q8CFE2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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