Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG3

Vcpip1, Deubiquitinating protein VCIP135, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcpip1Q8CDG3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms