Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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