Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1F5

Ttc16, Tetratricopeptide repeat protein 16, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc16Q8C1F5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ttc16Q8C1F5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc16Q8C1F5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc16Q8C1F5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ttc16Q8C1F5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc16Q8C1F5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ttc16Q8C1F5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ttc16Q8C1F5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc16Q8C1F5 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ttc16Q8C1F5 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc16Q8C1F5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc16Q8C1F5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc16Q8C1F5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ttc16Q8C1F5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ttc16Q8C1F5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc16Q8C1F5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc16Q8C1F5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc16Q8C1F5 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc16Q8C1F5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc16Q8C1F5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc16Q8C1F5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc16Q8C1F5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc16Q8C1F5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc16Q8C1F5 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc16Q8C1F5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc16Q8C1F5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc16Q8C1F5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc16Q8C1F5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc16Q8C1F5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc16Q8C1F5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ttc16Q8C1F5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc16Q8C1F5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc16Q8C1F5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc16Q8C1F5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc16Q8C1F5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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