Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0E3

Trim47, Tripartite motif-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim47Q8C0E3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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