Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Olfr192-202ENSMUST00000205727 1141 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gm10330-201ENSMUST00000072014 1354 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Trim35Q8C006 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gm5538-201ENSMUST00000168156 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gm29243-201ENSMUST00000188318 418 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Trim35Q8C006 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Trim35Q8C006 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Trim35Q8C006 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Trim35Q8C006 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
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Trim35Q8C006 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Trim35Q8C006 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Trim35Q8C006 Gm26832-201ENSMUST00000181456 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Tac1-205ENSMUST00000185187 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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