Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rbbp5Q8BX09 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rbbp5Q8BX09 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rbbp5Q8BX09 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rbbp5Q8BX09 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rbbp5Q8BX09 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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