Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtpaQ8BWP5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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