Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms