Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43Q8BUM9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp43Q8BUM9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp43Q8BUM9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp43Q8BUM9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp43Q8BUM9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp43Q8BUM9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp43Q8BUM9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp43Q8BUM9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp43Q8BUM9 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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