Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fbxo38Q8BMI0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Fbxo38Q8BMI0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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