Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKS9

Pum3, Pumilio homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum3Q8BKS9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pum3Q8BKS9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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