Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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