Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyp4f39Q8BGU0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms