Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD7

Npas4, Neuronal PAS domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas4Q8BGD7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas4Q8BGD7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas4Q8BGD7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas4Q8BGD7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas4Q8BGD7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas4Q8BGD7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas4Q8BGD7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas4Q8BGD7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas4Q8BGD7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas4Q8BGD7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas4Q8BGD7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas4Q8BGD7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas4Q8BGD7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas4Q8BGD7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas4Q8BGD7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas4Q8BGD7 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas4Q8BGD7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Npas4Q8BGD7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Npas4Q8BGD7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Npas4Q8BGD7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Npas4Q8BGD7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Npas4Q8BGD7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Npas4Q8BGD7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Npas4Q8BGD7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Npas4Q8BGD7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms