Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFW4

Trim65, Tripartite motif-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim65Q8BFW4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms