Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ChfrQ810L3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms