Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cracr2bQ80ZJ8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms