Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ttc29Q80VM3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ttc29Q80VM3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ttc29Q80VM3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ttc29Q80VM3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ttc29Q80VM3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ttc29Q80VM3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc29Q80VM3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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