Protein–RNA interactions for Protein: Q80U30

Clec16a, Protein CLEC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec16aQ80U30 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec16aQ80U30 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec16aQ80U30 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec16aQ80U30 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec16aQ80U30 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec16aQ80U30 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec16aQ80U30 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec16aQ80U30 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec16aQ80U30 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec16aQ80U30 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec16aQ80U30 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec16aQ80U30 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec16aQ80U30 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec16aQ80U30 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec16aQ80U30 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec16aQ80U30 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec16aQ80U30 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec16aQ80U30 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec16aQ80U30 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec16aQ80U30 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec16aQ80U30 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec16aQ80U30 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec16aQ80U30 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec16aQ80U30 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec16aQ80U30 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Clec16aQ80U30 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clec16aQ80U30 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clec16aQ80U30 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clec16aQ80U30 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clec16aQ80U30 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clec16aQ80U30 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clec16aQ80U30 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clec16aQ80U30 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clec16aQ80U30 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms