Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pja2Q80U04 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pja2Q80U04 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.05■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pja2Q80U04 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms