Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NischQ80TM9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms