Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms