Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNL3

Stk40, Serine/threonine-protein kinase 40, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk40Q7TNL3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stk40Q7TNL3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stk40Q7TNL3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stk40Q7TNL3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stk40Q7TNL3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Stk40Q7TNL3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stk40Q7TNL3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Stk40Q7TNL3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms